O Grupo de Oração Sementes de Paz é estruturado da seguinte forma: A cada semana é selecionado um assunto, que é desenvolvido e enviado antecipadamente aos participantes por e-mail, a fim de que estes possam se familiarizar com o tema escolhido e assim elaborar perguntas ou apartes, que serão levados a plenário. Os trabalhos do Grupo são coordenados de maneira alternada pelos seus componentes, ou seja, a cada semana uma pessoa diferente os coordena. Os trabalhos se iniciam com a invocação ao Espírito Santo, a fim de que Ele ilumine o coordenador e os participantes, seguida da exposição de intenções. Os temas são desenvolvidos de tal forma que a primeira parte de cada bloco seja uma mensagem bíblica e a segunda parte uma oração relacionada aos temas. A participação de cada membro do Grupo é livre e incentivada. Após a leitura dos blocos, cantam-se hinos de louvor. O encerramento ocorre com uma prece à Nossa Senhora: Maria, a primeira cristã, roga por nós! Tudo com Jesus, nada sem Maria!, para as orações finais, numa demonstração de integração, respeito e unidade. A força da união está na união das forças...